Dejavniki, ki vplivajo na ločljivost kromatografskega stolpca, so vrsta in lastnosti stacionarne faze (velikost delcev, porazdelitev velikosti delcev itd.), pogoji pakiranja, dolžina stolpca, vrsta in pretok mobilne faze ter lastnosti snovi, ki se uporabljajo za merjenje učinkovitosti stolpca. podrobnosti, kot sledi:
(1) Kromatografska dolžina in lastnosti polnila, daljši kot je kromatografski stolpec, boljša je analiza med sestavnimi deli, dlje ko je kromatografski stolpec, večji padec tlaka in vhodni tlak je omejen. Če je stolpec predolga, se bo povečalo razmerje tlaka med dovodom in izhodom, kar bo vplivalo na ločevanje kromatografskih vrhov;
(2) Glavni dejavnik je tudi velikost delcev kromatografskega stolpca. Bolj ko so delci finejši, boljša je resolucija zaradi povečanja površine, vendar bodo finejši delci povečali padec tlaka v stolpcu, kar bo imelo tudi neželen učinek;
(3) Temperatura stolpca ima velik vpliv tudi na analizo tekočega kromatografa, ker se topnost plina v tekočini ali stopnja adsorpcije na trdni površini zmanjša s povečanjem temperature. V plinsko-tekoči kromatografski analizi, ko temperatura presega določeno temperaturo, statične tekočine običajno izhlapejo iz stolpca, zato je treba pri izbiri temperature stolpca upoštevati vrelišče vzorca. Na splošno je nekoliko nižja od povprečne vrednosti vrelišča vzorca;
(4) Vpliv vrste plinskega kromatografa nosilnega plina. Običajno uporabljeni nosilni plini so N2, H2, He, Ar itd. Med njimi je molekularna teža H2 in He plina majhna, kar pomaga izboljšati hitrost analize, vendar se medij z višjo koncentracijo v njem zlahka oblikuje difuzijo, kar vpliva na stopnjo ločevanja, zato se v dejanski meritvi Medium H2 in He plini na splošno uporabljajo na območjih z nizko srednjo koncentracijo in povečajo svojo hitrost pretoka za zmanjšanje vpliva difuzije. Prednosti plinov z večjimi molekulskimi utežmi, kot sta N2 in Ar, so v tem, da je učinek difuzije majhen, prikrajšanost pa je, da je padec tlaka v stolpcu velik in pretok je počasen, to je obdobje analize je dolgo;
(5) Vpliv pretoka prenosnega plina. Čas bivanja medija na stacionarni fazi je v glavnem odvisen od značilnosti samega medija (volatilnost, polarnost itd.) in pretoka nosilnega plina. Zato hitrost pretoka neposredno vpliva na stopnjo ločitve;
(6) Vpliv časa injiciranja in volumna injiciranja. Čas injiciranja mora biti čim krajši. Načeloma bo takojšnje injiciranje izboljšalo ločljivost. Volumen injiciranja mora biti čim manjši, vendar ga mora detektor identificirati.
Zato je mogoče izboljšati ločljivost kromatografskega stolpca s povečanjem dolžine stolpca, zmanjšanjem volumna injiciranja, zmanjšanjem pretoka nosilnega plina, znižanjem temperature kromatografskega stolpca, povečanjem temperature vaporizacijske komore in zmanjšanjem mrtvega volumna sistema.