1. Glede na debelino kolone jo lahko razdelimo na dve vrsti: splošno pakirano kolono in kapilarno kolono.
Polnjena kromatografska kolona: Običajno se za oblikovanje spiralnih kolon uporabljajo cevi iz nerjavečega jekla z notranjim premerom 4-6 mm, pri čemer je običajno uporabljena dolžina kolone 2-4 metrov. Napolnite tekočo stacionarno fazo (plinsko-tekočinska kromatografija) ali trdno stacionarno fazo (plinsko-tekočinska kromatografija).
Kolona za kapilarno kromatografijo: Cev kolone je kapilarna cev, ki se običajno uporablja kot steklena ali elastična kapilarna cev iz kremena z notranjim premerom 0.1-0,5 mm, dolžina kolone pa sega od več deset metrov na stotine metrov.
Kolone za kapilarno kromatografijo lahko glede na metode polnjenja razdelimo na odprte kapilarne kolone in napolnjene kapilarne kolone.
2. Glede na mehanizem ločevanja ga lahko razdelimo na razdelilne in adsorpcijske kolone, pri čemer je glavna razlika v fiksni fazi.
Distribucijski stolpec: na splošno je stacionarna tekočina (tekočina z visokim vreliščem) prevlečena z nosilcem, da tvori tekočo stacionarno fazo, ločitev pa se izvede z razliko v porazdelitvenem koeficientu komponent. Funkcionalne skupine stacionarne raztopine so združene na površini nosilca preko kemične vezi, ki se imenuje faza kemične vezi. Prednost je, da ni izgube.
Adsorpcijska kolona: sestavljena je z nalaganjem adsorbenta v kromatografsko kolono, ločevanje pa se doseže z uporabo razlik v adsorpcijskih koeficientih komponent. Med trdne stacionarne faze poleg adsorbentov spadajo tudi molekularna sita in polimerne porozne mikrosfere.